Illustrator教程之蛋白质结构域示意图绘制软件 —— DOG 1.0
白羽 2018-08-15 来源 :网络 阅读 5811 评论 0

摘要:本文将带你了解Illustrator教程之蛋白质结构域示意图绘制软件 —— DOG 1.0,希望本文对大家学Illustrator有所帮助

        本文将带你了解Illustrator教程之蛋白质结构域示意图绘制软件 —— DOG 1.0,希望本文对大家学Illustrator有所帮助


  
  
    



 DOG 1.0: Illustrator of Protein Domain Structures.

         Jian Ren
, Longping 
  Wen, Xinjiao Gao, Changjiang Jin, Yu Xue
 and Xuebiao Yao.   Cell Research

 (2009)
 19:271–273.
 Abstract
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 | PDF
 | Supplementary information


    Schematic 
                                diagram of protein domain structures with functional 
                                motifs/sites is an important part in a large proportion 
                                of scientific articles which are focused on molecular 
                                and cellular researches. In order to estimate 
                                how many papers will contain protein domain graphs, 
                                we simply chose five typical molecular and cellular 
                                magazines, including Cell




                                  Nature 
                                Cell Biology



 
                                (NCB)
, The 
                                Journal of Cell Biology



 
                                (JCB)
, Molecular 
                                Biology of the Cell



 
                                (MBC)
 and Molecular 
                                and Cellular Biology



 
                                (MCB)
. Then we carefully read all research 
                                articles of the five journals published in 2007, 
                                while the reviews and other types of articles 
                                were not taken into account. Totally, there were 
                                551 of 1994 articles (27.6%


                                to contain at least one figure for protein domain 
                                structures. Thus, diagram of protein domain/motif 
                                structures in an attractive, concise and precise 
                                manner is greatly helpful for a broad readership 
                                to grasp the old and novel functions of proteins 
                                rapidly. 
    In this 
                                work, we present a novel software of DOG

 
                                (Domain Graph


                                version 1.0) for experimentalists, to prepare 
                                publication-quality figures of protein domain 
                                structures. The scale of a protein domain and 
                                the position of a functional motif/site will be 
                                precisely calculated. The DOG 1.0 was written 
                                in JAVA 1.5

 
                                (J2SE 5.0) and packed with Install4j 4.0.8. Thus, 
                                the DOG 1.0 could be easily installed on a computer. 
                                Then we developed several packages to support 
                                three major Operating Systems (OS), including 
                                Windows, Unix/Linux and Mac. The Windows XP, Fedora 
                                Core 6 OS (Linux), Apple Mac OS X 10.4 (Tiger) 
                                and 10.5 (Leopard) were chosen to test the stability 
                                of DOG1.0 software. For Windows and Linux systems, 
                                a Java Runtime Environment 6 (JRE) package of 
                                Sun Microsystems was also included. The DOG 1.0 
                                software is freely available from: //dog.biocuckoo.org


.


DOG 1.0 User Interface





 
 


     

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